YAMAMOTO Hiroyuki

山本博之 / やまもとひろゆき / Hiroyuki Yamamoto / 連絡先 h.yama2396@gmail.com / google scholar /
研究業績 / メモ / 山形県鶴岡市 (大阪→京都→神戸→鶴岡→川崎→鶴岡) / 会社員

オミックスデータの多変量解析 / エンリッチメント解析
- 多変量解析を用いたメタボロームデータ解析
  - 多変量解析を用いたメタボロームデータの可視化と、負荷量が解釈可能な手法の開発を行っています。( 詳しくはこちら )
  - Rのloadingsパッケージ [loadings: Loadings for Principal Component Analysis and Partial Least Squares]で計算可能です。
- エンリッチメント解析
  - パスウェイなどのデータベースとの関連を調べるための、エンリッチメント解析手法について研究しています。
  - エンリッチメント解析のためのRのパッケージmseapca[mseapca: Metabolite Set Enrichment Analysis for Loadings]をCRANで公開しています。
- 参考資料
  - 山本博之, "多変量解析，エンリッチメント解析，代謝マップ描画", メタボロミクス実践ガイド, 羊土社, 2021.[ link ]

質量分析インフォマティクス
- 質量分析インフォマティクス研究会
  - 年1回、研究会ワークショップ、ハッカソン、ソフトウェア講習会、IIBMPでのワークショップを行っています。
- Rで質量分析インフォマティクス
  - Rで質量分析データを処理するための技術資料です。少しずつ作成しているところです。完成はまだまだ先です。(作成中)
- 創発的再解析のためのメタボローム統合データベース(統合化推進プログラム 2024～)
  - 参考文献　iDMET: network-based approach for integrating differential analysis of cancer metabolomics